联合国反罪恶组织探员米奇因一次行动失误，拍档被杀而陷于自责之中，其上司尼克为了挽回米奇的自信心，特别派遣美艳动人的特务莎比，与他一起调查名画“午夜之眼”的失窃案。怎料案件背后原来隐藏着另一个惊世大阴谋，二人于是假扮夫妻，不惜千里迢迢远赴香港企图阻止事件发生。可惜事与愿违，二人身份被揭穿，危机一触即发……究竟米奇能否重拾昔日雄风，击破这个大阴谋？而他与莎比的关系又会否弄假成真？

联合国反罪恶组织探员米奇因一次行动失误，拍档被杀而陷于自责之中，其上司尼克为了挽回米奇的自信心，特别派遣美艳动人的特务莎比，与他一起调查名画“午夜之眼”的失窃案。怎料案件背后原来隐藏着另一个惊世大阴谋，二人于是假扮夫妻，不惜千里迢迢远赴香港企图阻止事件发生。可惜事与愿违，二人身份被揭穿，危机一触即发……究竟米奇能否重拾昔日雄风，击破这个大阴谋？而他与莎比的关系又会否弄假成真？

本片反映的是香港九七回归前后，中国大陆和香港两地警察携手合作，形成警网雄风，共同打击犯罪活动的故事。 香港警署重案组接到报案，有匪徒打击珠宝工厂。伏击中，双方各有死伤，匪徒最终逃脱，偷渡回大陆。随着案情侦破的展开，警方发现近期发生的贩毒、抢劫、走私、绑架等一系列犯罪活动，都是一个香港和中国南华市内外勾结的大黑邦所为，黑邦头子是小商人起家的何仲豪。 中国南华市公安局剁侦大队大队长陈向叙副大队长王倚红受上级委派，与香港警署合作，共同侦破这一系列大案。在办案的过程中，两地警方不断交流、互通情报，建立起良好的合作关系，取得了一个又一个胜利。 《警网雄风》在反映打击罪恶活动的同时，还表现了男女主人公英勇、机智、侠肝义胆、疾恶如仇的高尚品格。在办案的过程中，大陆和香港两地警察结下的爱情、亲情、友情的故事在剧中也有生动的体现

女子特警队训练出的一批超级女警，小颜就是其实的一个。为了捉拿罪犯，她不惜潜入黑帮成为卧底，靠着拳头取得了黑道老大的信任……

利比亚恐怖分子到港刺杀来港开会的美国政要,香港警方派出雷勇领导的特工队侦查此案，目的是消灭此批恐怖分子。由于此案交政治部负责，令到重案组高级督察许达明感到不满，暗中插手调查此案。他误交了以女记者身份掩护的恐怖分子首领Catherine，被她杀害了。特工队队员陈志成的表妹Stella亦卷入这案的漩涡中，被恐怖分子所杀。特工队经过慎密调查和计划，在恐怖分子企图刺杀来港开会的政时出动……

女子特警队训练出的一批超级女警，小颜就是其实的一个。为了捉拿罪犯，她不惜潜入黑帮成为卧底，靠着拳头取得了黑道老大的信任……

香港某个国际伪钞集团重要分子宋子豪（狄龙 饰）和Mark（周润发 饰）情同手足，某次宋子豪带手下谭成（李子雄 饰）去台北交易时被其出卖受枪伤被捕入狱，为替好兄弟报仇，Mark孤身赴台，结果被人打成瘸子，江湖地位自此一落千丈，而宋子豪的父亲也在不久丧命。 一向视宋子豪为偶像的宋子杰（张国荣 饰）得知哥哥的真实身份后，对黑社会及他恨之入骨，立誓利用警察身份将黑帮势力斩草除根，宋子豪出狱后不顾苦等他想重创辉煌的Mark的劝阻，决心弃暗投明，无奈得不到宋子杰的谅解。而此时已成帮会老大的谭成欲找宋子豪再合作，遭拒绝后放言会害宋子杰，被逼走投无路，宋子豪决定再与Mark连手共抗强敌。

家庭主妇朱莉拥有一个幸福的家庭:深爱着她的老公和一个13岁的漂亮女儿。但处在青春期的女儿克里斯蒂迷恋上了网络，并在网上和网友们频频聊天。一个偶然的机会，朱莉看到了克里斯蒂的聊天记录，得知她已经约了网友见面。朱莉不顾一切地赶到网上所说的约会地点，不出朱莉的意料，和女儿约会的网友确实是一名动机不纯的中年男子。朱莉将女儿带回家，在教育孩子的同时，朱莉决定找个可以说理的地方。朱莉来到了警察局，由于和克里斯蒂约会的网友并没有对她的人身造成杀害，所以警察局无法立案。想到可能会有成千上万的女孩和自己的女儿一样被那些居心叵测的男人伤害，朱莉心中无法平静。她不能坐视不理，于是要求由自己在网上扮成少女，聊天记录作为证据，当心怀不轨的网友出来见面时，警察就可以将他们一网打尽……

特工艾利克隶属FBI海外秘密部门，因执行任务失败被撤职，以维修电话为生。一伙雇佣兵闯入艾利克父亲所在的化工厂，企图炸掉化工厂释放神经毒气要挟政府释放重刑犯克鲁格并索要2千万美金的钻石做为赎金。若毒气被释放，整个城市几百万人口将无一幸存。艾利克通过维修电话线路意外收听到匪徒与政府的交易，单枪匹马潜入化工厂。殊不知这是FBI策划的一场阴谋，意图除掉艾利克。深陷危机的艾利克只能搏命反击，与FBI幕后黑手展开一连串的火爆对峙……

情报科窃听小组三兄弟情同手足，梁俊义（刘青云 饰）正直而又懦弱，在个人感情问题上托泥带水；杨真（古天乐 饰）家境窘困，不仅要应付身患白血病儿子的随时可能出现的突发情况，而且自己也病入膏肓，命不久矣；林一祥（吴彦祖 饰）年轻有为，满怀雄心，如今又“嫁入豪门”，前途不可限量。

香港某个国际伪钞集团重要分子宋子豪（狄龙 饰）和Mark（周润发 饰）情同手足，某次宋子豪带手下谭成（李子雄 饰）去台北交易时被其出卖受枪伤被捕入狱，为替好兄弟报仇，Mark孤身赴台，结果被人打成瘸子，江湖地位自此一落千丈，而宋子豪的父亲也在不久丧命。 一向视宋子豪为偶像的宋子杰（张国荣 饰）得知哥哥的真实身份后，对黑社会及他恨之入骨，立誓利用警察身份将黑帮势力斩草除根，宋子豪出狱后不顾苦等他想重创辉煌的Mark的劝阻，决心弃暗投明，无奈得不到宋子杰的谅解。而此时已成帮会老大的谭成欲找宋子豪再合作，遭拒绝后放言会害宋子杰，被逼走投无路，宋子豪决定再与Mark连手共抗强敌。

第一部中，小马哥（周润发 饰）死在乱枪之下，宋子豪（狄龙 饰）和弟弟宋子杰（张国荣 饰）冰释前嫌，英雄的故事还在继续。